Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms