Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms