Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Bhlhe41Q99PV5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms