Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Brms1Q99N20 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Brms1Q99N20 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Brms1Q99N20 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Brms1Q99N20 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Brms1Q99N20 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Brms1Q99N20 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms