Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac9Q99N13 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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