Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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