Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psmd6Q99JI4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psmd6Q99JI4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psmd6Q99JI4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psmd6Q99JI4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psmd6Q99JI4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psmd6Q99JI4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psmd6Q99JI4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms