Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ctu1Q99J10 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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