Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms