Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms