Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Lin28aQ8K3Y3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lin28aQ8K3Y3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lin28aQ8K3Y3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lin28aQ8K3Y3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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