Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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