Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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