Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc15Q8C9M2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms