Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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