Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl16Q8BSU2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms