Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan18Q80WR1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan18Q80WR1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms