Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms