Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms