Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms