Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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