Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms