Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltcQ68FD5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms