Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vsx2Q61412 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vsx2Q61412 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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