Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnot7Q60809 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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