Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkn2cQ60772 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms