Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms