Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SkiQ60698 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms