Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms