Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms