Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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