Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eme2Q56A04 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms