Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms