Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms