Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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