Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms