Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms