Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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