Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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