Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy4Q3TYX8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms