Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms