Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms