Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms