Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cd300lgQ1ERP8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms