Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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