Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddr1Q03146 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms