Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp39Q02525 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms