Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms