Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms