Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms